Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPRMP28827 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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