Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NMBRP28336 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms