Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms