Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CD27P26842 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CD27P26842 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CD27P26842 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms