Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CALB2P22676 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CALB2P22676 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms