Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDSP20132 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDSP20132 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SDSP20132 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SDSP20132 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SDSP20132 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SDSP20132 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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