Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms