Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ERCC2P18074 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms