Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DESP17661 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DESP17661 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DESP17661 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms