Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GFAPP14136 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GFAPP14136 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms