Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
COL6A2P12110 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms