Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
UBL4AP11441 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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