Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TMEM225BP0DP42 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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