Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CALM2P0DP24 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CALM2P0DP24 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms