Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF2P04141 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSF2P04141 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CSF2P04141 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms