Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZBED1O96006 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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