Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCNDBP1O95273 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms