Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GCATO75600 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GCATO75600 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GCATO75600 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCATO75600 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms