Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNSO60931 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNSO60931 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNSO60931 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNSO60931 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNSO60931 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNSO60931 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNSO60931 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNSO60931 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTNSO60931 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CTNSO60931 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CTNSO60931 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CTNSO60931 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CTNSO60931 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CTNSO60931 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CTNSO60931 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CTNSO60931 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CTNSO60931 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CTNSO60931 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CTNSO60931 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CTNSO60931 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CTNSO60931 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNSO60931 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNSO60931 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNSO60931 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNSO60931 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CTNSO60931 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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