Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLXNC1O60486 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PLXNC1O60486 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms