Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDB2O43679 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDB2O43679 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDB2O43679 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDB2O43679 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDB2O43679 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDB2O43679 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDB2O43679 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDB2O43679 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDB2O43679 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDB2O43679 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDB2O43679 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDB2O43679 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDB2O43679 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDB2O43679 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDB2O43679 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LDB2O43679 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDB2O43679 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LDB2O43679 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LDB2O43679 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LDB2O43679 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms