Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3AO14802 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms