Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPRTO14522 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
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