Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PODXLO00592 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PODXLO00592 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PODXLO00592 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PODXLO00592 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PODXLO00592 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PODXLO00592 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PODXLO00592 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PODXLO00592 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PODXLO00592 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PODXLO00592 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PODXLO00592 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PODXLO00592 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PODXLO00592 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PODXLO00592 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PODXLO00592 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PODXLO00592 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PODXLO00592 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PODXLO00592 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PODXLO00592 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PODXLO00592 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PODXLO00592 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PODXLO00592 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PODXLO00592 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PODXLO00592 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PODXLO00592 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PODXLO00592 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PODXLO00592 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PODXLO00592 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PODXLO00592 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms