Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
E9PCH4 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E9PCH4 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E9PCH4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
E9PCH4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E9PCH4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E9PCH4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
E9PCH4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E9PCH4 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms