Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM247A6NEH6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms