Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSZ3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WSZ3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
A0A087WSZ3 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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