Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E7

CHMP3, Charged multivesicular body protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP3Q9Y3E7 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHMP3Q9Y3E7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms