Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VPS4AQ9UN37 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms