Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SYNPO2Q9UMS6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms