Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIMKLBQ9ULI2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms