Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SPASTQ9UBP0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPASTQ9UBP0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms