Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CCDC88CQ9P219 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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CCDC88CQ9P219 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CCDC88CQ9P219 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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CCDC88CQ9P219 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CCDC88CQ9P219 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CCDC88CQ9P219 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC88CQ9P219 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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