Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SCHIP1Q9P0W5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms