Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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SH3BP4Q9P0V3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SH3BP4Q9P0V3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SH3BP4Q9P0V3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SH3BP4Q9P0V3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SH3BP4Q9P0V3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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SH3BP4Q9P0V3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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SH3BP4Q9P0V3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SH3BP4Q9P0V3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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