Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CNIH4Q9P003 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms