Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CNTLNQ9NXG0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTLNQ9NXG0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms