Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATG3Q9NT62 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms