Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOMER3Q9NSC5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms