Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SNX15Q9NRS6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SNX15Q9NRS6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SNX15Q9NRS6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SNX15Q9NRS6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SNX15Q9NRS6 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SNX15Q9NRS6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SNX15Q9NRS6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SNX15Q9NRS6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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SNX15Q9NRS6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX15Q9NRS6 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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