Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ARFGAP3Q9NP61 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ARFGAP3Q9NP61 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms