Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVK-5Q9HDB9 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms