Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BPESC1Q9GZL8 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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