Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIFKQ9BYG3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms