Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC46A2Q9BY10 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms