Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB11FIP5Q9BXF6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB11FIP5Q9BXF6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms