Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SALL3Q9BXA9 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SALL3Q9BXA9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms