Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCMBPQ9BTE3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms