Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HERPUD2Q9BSE4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms