Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SEMA3CQ99985 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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SEMA3CQ99985 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SEMA3CQ99985 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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